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如果在苹果手机上方的通知栏看到短信数字提示，但在短信应用中找不到未读短信，可能有以下几种原因。
1、短信可能被归类到了其他文件夹或者标签中，尝试在“短信”应用的搜索栏中输入关键词，查看是否可以将未读短信搜索出来，检查是否有创建多个文件夹或标签，并确认短信是否被归类到了某个特定的文件夹或标签下。
2、短信可能被标记为已读或已删除，有时由于操作不当，可能会误触将短信标记为已读或移动到其他位置，可以尝试在“最近删除”文件夹中查找已删除的短信。
3、可能是系统显示的问题，尝试重启设备，看是否可以解决问题。
4、如果使用了某些第三方短信应用，可能存在应用与系统之间的兼容性问题，尝试切换到官方的短信应用，看是否可以正常查看未读短信。
5、检查是否有足够的存储空间，如果设备存储空间不足，可能会影响短信的正常显示，可以尝试清理一些不需要的文件或应用，释放存储空间。
如果以上方法都无法解决问题，建议备份设备数据并尝试恢复系统，或者联系苹果官方客服寻求帮助。